構建生物資料疾病相關環狀RNA-microRNA-mRNA相互作用網絡之應用平台
- 榮總三總中研院合作研究計畫 @ 學術及儀器事務處

計畫名稱(中文)構建生物資料疾病相關環狀RNA-microRNA-mRNA相互作用網絡之應用平台的計畫類別是榮總三總中研院合作研究計畫, 主持人姓名是莊樹諄, 中研院計畫編號是AS-VTA-109-03, 主持人所屬單位是基因體中心, 執行年度是109, 研究期程 (起)是109-01, 研究期程 (迄)是109-12, 計畫名稱(英文)是Development of a one-stop software for constructing disease-related circular RNA-microRNA-mRNA interaction networks, 核定編號是AS-VTA-109-03.

執行年度	109
計畫類別	榮總三總中研院合作研究計畫
核定編號	AS-VTA-109-03
中研院計畫編號	AS-VTA-109-03
主持人姓名	莊樹諄
主持人類別	分支計畫主持人
主持人所屬單位	基因體中心
計畫名稱(中文)	構建生物資料疾病相關環狀RNA-microRNA-mRNA相互作用網絡之應用平台
計畫名稱(英文)	Development of a one-stop software for constructing disease-related circular RNA-microRNA-mRNA interaction networks
研究期程 (起)	109-01
研究期程 (迄)	109-12

執行年度

109

計畫類別

榮總三總中研院合作研究計畫

核定編號

AS-VTA-109-03

中研院計畫編號

AS-VTA-109-03

主持人姓名

莊樹諄

主持人類別

分支計畫主持人

主持人所屬單位

基因體中心

計畫名稱(中文)

構建生物資料疾病相關環狀RNA-microRNA-mRNA相互作用網絡之應用平台

計畫名稱(英文)

Development of a one-stop software for constructing disease-related circular RNA-microRNA-mRNA interaction networks

研究期程 (起)

109-01

研究期程 (迄)

109-12

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莊樹諄	聘書職級: 教授 \| 專兼任: 兼任 \| 單位名稱: 基因體與系統生物學學位學程 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 \| 教師專長: 比較暨演化基因體、生物資訊、基因網路 @ 大學校院教師學術專長彙整表
莊樹諄	聘書職級: 教授 \| 專兼任: 兼任 \| 單位名稱: 生命科學系 \| 學校名稱: 國立臺灣師範大學 \| 教師專長: 基因體註解、演化分析上相關技術的研發 @ 大學校院教師學術專長彙整表
運用跨物種EST序列來尋找新的外顯子以及選擇性剪接事件	作者: 王宥崴 \| 指導教授: 莊樹諄楊致芳 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 102 \| 論文名稱(外文): A cross-species EST-based pipeline for identification of exons and alternatively spliced variants \| 系所名稱: 資訊工程學系 \| 學校名稱: 國立臺北大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
全面性分析在自閉症表現量異常的環狀核糖核酸及環狀核糖核酸–微小核糖核酸–信使核糖核酸間相互調控網路	作者: 陳彥如 \| 指導教授: 莊樹諄 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 108 \| 論文名稱(外文): Integrative analysis of circular RNA dysregulation and circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in... \| 系所名稱: 基因體與系統生物學學位學程 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
探討草履蟲與綠藻共生之分子機制	作者: 鄭毓鋗 \| 指導教授: 呂俊毅莊樹諄 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 108 \| 論文名稱(外文): Molecular mechanisms of endosymbiosis between Paramecium bursaria and Chlorella spp. \| 系所名稱: 基因體與系統生物學學位學程 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統

莊樹諄

聘書職級: 教授 | 專兼任: 兼任 | 單位名稱: 基因體與系統生物學學位學程 | 學校名稱: 國立臺灣大學 | 教師專長: 比較暨演化基因體、生物資訊、基因網路

@ 大學校院教師學術專長彙整表

莊樹諄

聘書職級: 教授 | 專兼任: 兼任 | 單位名稱: 生命科學系 | 學校名稱: 國立臺灣師範大學 | 教師專長: 基因體註解、演化分析上相關技術的研發

@ 大學校院教師學術專長彙整表

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與構建生物資料疾病相關環狀RNA-microRNA-mRNA相互作用網絡之應用平台同分類的榮總三總中研院合作研究計畫

以小鼠模型建立並鑑識新的亨丁頓氏症的生物標誌	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳儀莊 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 105 \| 研究期程 (起): 105-01 \| 研究期程 (迄): 105-12 \| 計畫名稱(英文): Identification of novel biomarkers of Huntington’s disease in mouse models. \| 核定編號: VTA105-A-2-1
Meta1 G 蛋白耦合受體信息網路對前列腺癌轉移之探討	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 蕭培文 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 農生中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Investigating the Role of Meta1-Mediated GPCR Network in Cancer Metastasis Evolution through CRISPR-... \| 核定編號: VTA106-T-4-2
利用人類誘導式全能性幹細胞所分化之運動神經細胞及神經肌肉類器官體來界定環形核糖核酸作為治療肌萎縮性脊髓側索硬化症的標的	計畫類別: 與醫學中心合作及合聘計畫 \| 主持人姓名: 郭紘志 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-111-02 \| 主持人所屬單位: 細胞與個體生物學研究中心 \| 執行年度: 111 \| 研究期程 (起): 111-01 \| 研究期程 (迄): 111-12 \| 計畫名稱(英文): Characterizing circular RNA as a therapeutic target for amyotrophic lateral sclerosis using disease ... \| 核定編號: VTA111-V1-1-3
乳癌(腎細胞癌)轉移的預測基因標記及治療	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 謝叔蓉 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-09 \| 主持人所屬單位: 統計所 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): Gene signatures and treatments for Predicting metastasis in Breast (Renal Cell) Cancer \| 核定編號: AS-VTA-109-09
(第二年)設計並建立群集循環腫瘤細胞濃縮及分析的流程	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 張瑛芝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Design and construct a workflow to enrich patient circulating tumor cells and clusters for molecular... \| 核定編號: VTA106-V1-3- 1
SCUBE1加強骨形態發生蛋白信息傳遞於腎損傷之功能分析	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 楊瑞彬 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 105 \| 研究期程 (起): 105-01 \| 研究期程 (迄): 105-12 \| 計畫名稱(英文): Functional studies of SCUBE1-enhanced bone morphogenetic protein signaling in renal injury (3-year p... \| 核定編號: VTA105-T-3-1
探討Blimp-1在Breg細胞中如何參與實驗性自體免疫性腦脊髓炎的發生 (第二年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 林國儀 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Study of the effects of Blimp-1 in Breg cells on the development of experimental autoimmune encephal... \| 核定編號: VTA106-T-1-2
去乙醯化酶 (Sirt1)在肺動脈高壓的病理生理學角色之活體研究 (第2 年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳燕輝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Identification of Genes and Oncogenic miRNAs Involved in Colorectal Cancer Susceptibility and Progre... \| 核定編號: VTA106-V1-4- 3
設計並建立群集循環腫瘤細胞濃縮及分析的流程	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 張瑛芝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Design and construct a workflow to enrich patient circulating tumor cells and clusters for molecular... \| 核定編號: VTA107-V1-3-3
以人肝嵌合小鼠模式探討B型肝炎病毒野生型與刪除型突變株的外套抗原前區影響病毒複製、裝配、釋放與致病性的關鍵區域與氨基酸(第三年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陶秘華 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Investigation of critical domains and amino acids in the Pre-S region of hepatitis B virus (HBV) in ... \| 核定編號: VTA107-V1-2-2
間歇性斷食、微生物相及神經發炎反應在帕金森氏症的互動關係	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 林仲彥 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-08 \| 主持人所屬單位: 資訊所 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): \| 核定編號: AS-VTA-109-08
以小鼠模型建立並鑑識新的亨丁頓氏症的生物標誌(三年期計畫之第三年）	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳儀莊 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Identification of novel biomarkers of Huntington's disease in mouse models (the third year of the 3-... \| 核定編號: VTA107-A-1-1
蛋白磷酸化修飾於鮑氏不動桿菌之生物膜抵抗多重抗生素的調控機制	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 吳世雄 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-108-01 \| 主持人所屬單位: 生化所 \| 執行年度: 108 \| 研究期程 (起): 108-01 \| 研究期程 (迄): 108-12 \| 計畫名稱(英文): Protein Phosphorylation mediated multiple drug resistant mechanism in biofilm-embedded Acinetobacter... \| 核定編號: AS-VTA-108-01
紅斑性狼瘡患者的身體微生物菌相之代謝基因與產物分析	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 嚴仲陽 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-108-13 \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 108 \| 研究期程 (起): 108-01 \| 研究期程 (迄): 108-12 \| 計畫名稱(英文): Study on short chain fatty acid gene cluster composition and metabolites in patients with SLE \| 核定編號: AS-VTA-108-13
醣結合蛋白在慢性傷口癒合上的在上皮化與發炎反應的功能	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳煥源 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-13 \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): Roles of galectins in re-epithelization and inflammation of chronic wound healing \| 核定編號: AS-VTA-109-13