建立剖析 SARS-CoV-2 感染程序的 NGS 分析模型
- 榮總三總中研院合作研究計畫 @ 學術及儀器事務處

計畫名稱(中文)建立剖析 SARS-CoV-2 感染程序的 NGS 分析模型的計畫類別是與醫學中心合作及合聘計畫, 主持人姓名是楊欣洲, 中研院計畫編號是AS-VTA-111-07, 主持人所屬單位是統計科學研究所, 執行年度是111, 研究期程 (起)是111-01, 研究期程 (迄)是111-12, 計畫名稱(英文)是Establishing NGS analytical model for understanding the infectious program of SARS-CoV-2, 核定編號是VTA111-V1-4-3.

執行年度	111
計畫類別	與醫學中心合作及合聘計畫
核定編號	VTA111-V1-4-3
中研院計畫編號	AS-VTA-111-07
主持人姓名	楊欣洲
主持人類別	分支計畫主持人
主持人所屬單位	統計科學研究所
計畫名稱(中文)	建立剖析 SARS-CoV-2 感染程序的 NGS 分析模型
計畫名稱(英文)	Establishing NGS analytical model for understanding the infectious program of SARS-CoV-2
研究期程 (起)	111-01
研究期程 (迄)	111-12

執行年度

111

計畫類別

與醫學中心合作及合聘計畫

核定編號

VTA111-V1-4-3

中研院計畫編號

AS-VTA-111-07

主持人姓名

楊欣洲

主持人類別

分支計畫主持人

主持人所屬單位

統計科學研究所

計畫名稱(中文)

建立剖析 SARS-CoV-2 感染程序的 NGS 分析模型

計畫名稱(英文)

Establishing NGS analytical model for understanding the infectious program of SARS-CoV-2

研究期程 (起)

111-01

研究期程 (迄)

111-12

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統計科學研究所	OID: 2.16.886.101.20002.20001.20010 \| 電話: 02-27835611 \| 地址: 臺北市南港區研究院路二段128號 \| DN: ou=統計科學研究所,ou=中央研究院,o=總統府,c=TW @ 政府機關唯一識別代碼(OID)
中央研究院統計科學研究所圖書室	圖書館類型: 專門圖書館 \| 中文地址: 臺北市南港區研究院路二段128號中央研究院統計科學研究所圖書館 \| 郵遞區號: 115 @ 圖書館名錄
中華機率統計學會	OID: 2.16.886.119.100686 \| 電話: 02-6614-5691 \| 地址: 台北市南港區研究院路二段128號中央研究院統計科學研究所 \| DN: o=中華機率統計學會,c=TW @ 組織及團體憑證唯一識別編碼
廣義掃描統計量在腸病毒資料的應用	作者: 陳立瑋 \| 指導教授: 林培生 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 103 \| 論文名稱(外文): \| 系所名稱: 數學系統計科學研究所 \| 學校名稱: 國立中正大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
相關右設限資料下存活函數之估計	作者: 蕭淑婷 \| 指導教授: 謝進見 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 102 \| 論文名稱(外文): The estimation of survival function under dependent right censored data \| 系所名稱: 數學系統計科學研究所 \| 學校名稱: 國立中正大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
相關設限下現狀資料存活函數之估計	作者: 陳永諭 \| 指導教授: 謝進見 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 102 \| 論文名稱(外文): The survival function estimation of current status data with dependent censoring \| 系所名稱: 數學系統計科學研究所 \| 學校名稱: 國立中正大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
半競爭風險資料下估計非終端事件時間之存活函數	作者: 許家豪 \| 指導教授: 謝進見 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 102 \| 論文名稱(外文): Estimating the survival function of the non-terminal event time under semi-competing risks data \| 系所名稱: 數學系統計科學研究所 \| 學校名稱: 國立中正大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
相關截切資料下存活函數估計之穩健性評估	作者: 張珮嫚 \| 指導教授: 謝進見 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 103 \| 論文名稱(外文): Robustness Examination for The Survival Function Estimation under A Dependent Truncation \| 系所名稱: 數學系統計科學研究所 \| 學校名稱: 國立中正大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統

統計科學研究所

OID: 2.16.886.101.20002.20001.20010 | 電話: 02-27835611 | 地址: 臺北市南港區研究院路二段128號 | DN: ou=統計科學研究所,ou=中央研究院,o=總統府,c=TW

@ 政府機關唯一識別代碼(OID)

中央研究院統計科學研究所圖書室

圖書館類型: 專門圖書館 | 中文地址: 臺北市南港區研究院路二段128號中央研究院統計科學研究所圖書館 | 郵遞區號: 115

@ 圖書館名錄

中華機率統計學會

OID: 2.16.886.119.100686 | 電話: 02-6614-5691 | 地址: 台北市南港區研究院路二段128號中央研究院統計科學研究所 | DN: o=中華機率統計學會,c=TW

@ 組織及團體憑證唯一識別編碼

廣義掃描統計量在腸病毒資料的應用

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半競爭風險資料下估計非終端事件時間之存活函數

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楊欣洲	聘書職級: 教授 \| 專兼任: 兼任 \| 單位名稱: 統計學系 \| 學校名稱: 國立成功大學 \| 教師專長: 基因體與遺傳統計、生物資訊、生態統計 @ 大學校院教師學術專長彙整表
統計代謝體學研究	作者: 梁佑任 \| 指導教授: 趙坤茂楊欣洲 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 104 \| 論文名稱(外文): Statistical Metabolomics Study \| 系所名稱: 生醫電子與資訊學研究所 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
使用序列核關聯檢定偵測家族資料的基因與環境交互作用	作者: 王仁宏 \| 指導教授: 郭炤裕楊欣洲 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 105 \| 論文名稱(外文): Detecting Family-Based Gene-Environment Interaction Using Sequence Kernel Association Test (FGESKAT) \| 系所名稱: 公共衛生研究所 \| 學校名稱: 國立陽明大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
分析新世代人種優化生物晶片產出之雜交強度和基因型資料的整合分析工具	作者: 黃美菊 \| 指導教授: 楊欣洲 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 105 \| 論文名稱(外文): An Integrated Analysis Tool for Analyzing Hybridization Intensities and Genotypes Using New-Generati... \| 系所名稱: 生物醫學資訊研究所 \| 學校名稱: 國立陽明大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
跨族群間的DNA甲基化差異及其對藥物表觀基因學的影響	作者: 朱是鍇 \| 指導教授: 楊欣洲 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 106 \| 論文名稱(外文): Interethnic DNA Methylation Difference and its Implications in Pharmacoepigenetics \| 系所名稱: 生物醫學資訊研究所 \| 學校名稱: 國立陽明大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
使用序列核關聯檢定偵測家族資料的基因與環境交互作用之最佳檢定	作者: 張瀞文 \| 指導教授: 郭炤裕楊欣洲 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 106 \| 論文名稱(外文): Optimal Tests For Family-Based Gene-Environment Interaction Using Sequence Kernel Association Test \| 系所名稱: 公共衛生研究所 \| 學校名稱: 國立陽明大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
利用罕見變異強度估計來進行複雜疾病的致病基因定位	作者: 魏宛昱 \| 指導教授: 楊欣洲郭炤裕 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 106 \| 論文名稱(外文): Gene Mapping for Complex Disorders by Using an Estimation of Rare Variant Intensity \| 系所名稱: 公共衛生研究所 \| 學校名稱: 國立陽明大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
刪除連鎖不平衡以改善族群結構的校正	作者: 胡盛淵 \| 指導教授: 楊欣洲郭炤裕 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 109 \| 論文名稱(外文): Improving the adjustment for population structure through a removal of linkage disequilibrium \| 系所名稱: 公共衛生研究所 \| 學校名稱: 國立陽明交通大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統

楊欣洲

聘書職級: 教授 | 專兼任: 兼任 | 單位名稱: 統計學系 | 學校名稱: 國立成功大學 | 教師專長: 基因體與遺傳統計、生物資訊、生態統計

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與建立剖析 SARS-CoV-2 感染程序的 NGS 分析模型同分類的榮總三總中研院合作研究計畫

(第二年)設計並建立群集循環腫瘤細胞濃縮及分析的流程	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 張瑛芝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Design and construct a workflow to enrich patient circulating tumor cells and clusters for molecular... \| 核定編號: VTA106-V1-3- 1
SCUBE1加強骨形態發生蛋白信息傳遞於腎損傷之功能分析	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 楊瑞彬 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 105 \| 研究期程 (起): 105-01 \| 研究期程 (迄): 105-12 \| 計畫名稱(英文): Functional studies of SCUBE1-enhanced bone morphogenetic protein signaling in renal injury (3-year p... \| 核定編號: VTA105-T-3-1
探討Blimp-1在Breg細胞中如何參與實驗性自體免疫性腦脊髓炎的發生 (第二年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 林國儀 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Study of the effects of Blimp-1 in Breg cells on the development of experimental autoimmune encephal... \| 核定編號: VTA106-T-1-2
去乙醯化酶 (Sirt1)在肺動脈高壓的病理生理學角色之活體研究 (第2 年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳燕輝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): Identification of Genes and Oncogenic miRNAs Involved in Colorectal Cancer Susceptibility and Progre... \| 核定編號: VTA106-V1-4- 3
設計並建立群集循環腫瘤細胞濃縮及分析的流程	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 張瑛芝 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Design and construct a workflow to enrich patient circulating tumor cells and clusters for molecular... \| 核定編號: VTA107-V1-3-3
以人肝嵌合小鼠模式探討B型肝炎病毒野生型與刪除型突變株的外套抗原前區影響病毒複製、裝配、釋放與致病性的關鍵區域與氨基酸(第三年)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陶秘華 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Investigation of critical domains and amino acids in the Pre-S region of hepatitis B virus (HBV) in ... \| 核定編號: VTA107-V1-2-2
間歇性斷食、微生物相及神經發炎反應在帕金森氏症的互動關係	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 林仲彥 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-08 \| 主持人所屬單位: 資訊所 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): \| 核定編號: AS-VTA-109-08
以小鼠模型建立並鑑識新的亨丁頓氏症的生物標誌(三年期計畫之第三年）	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳儀莊 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Identification of novel biomarkers of Huntington's disease in mouse models (the third year of the 3-... \| 核定編號: VTA107-A-1-1
蛋白磷酸化修飾於鮑氏不動桿菌之生物膜抵抗多重抗生素的調控機制	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 吳世雄 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-108-01 \| 主持人所屬單位: 生化所 \| 執行年度: 108 \| 研究期程 (起): 108-01 \| 研究期程 (迄): 108-12 \| 計畫名稱(英文): Protein Phosphorylation mediated multiple drug resistant mechanism in biofilm-embedded Acinetobacter... \| 核定編號: AS-VTA-108-01
紅斑性狼瘡患者的身體微生物菌相之代謝基因與產物分析	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 嚴仲陽 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-108-13 \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 108 \| 研究期程 (起): 108-01 \| 研究期程 (迄): 108-12 \| 計畫名稱(英文): Study on short chain fatty acid gene cluster composition and metabolites in patients with SLE \| 核定編號: AS-VTA-108-13
醣結合蛋白在慢性傷口癒合上的在上皮化與發炎反應的功能	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 陳煥源 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-13 \| 主持人所屬單位: 生醫所 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): Roles of galectins in re-epithelization and inflammation of chronic wound healing \| 核定編號: AS-VTA-109-13
免疫風濕疾病患者C 型肝炎病毒感染之細胞因子及基因體研究(2/3)	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 謝世良 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 106 \| 研究期程 (起): 106-01 \| 研究期程 (迄): 106-12 \| 計畫名稱(英文): The study of cellular factors and genomics associated with HCV infection in rheumatic patients \| 核定編號: VTA106-V2-1- 2
利用法布瑞氏症細胞株開發設計可減緩Gb3受質堆積的新穎小分子化合物	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 鄭偉杰 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-109-02 \| 主持人所屬單位: 基因體中心 \| 執行年度: 109 \| 研究期程 (起): 109-01 \| 研究期程 (迄): 109-12 \| 計畫名稱(英文): Design and synthesis of new small molecules to reduce Gb3 accumulation using Fabry cell lines. \| 核定編號: AS-VTA-109-02
以情境辨識為基礎之主動式抗噪演算法設計	計畫類別: 榮總三總中研院合作研究計畫 \| 主持人姓名: 曹昱 \| 中研院計畫編號: \| 主持人所屬單位: 資創中心 \| 執行年度: 107 \| 研究期程 (起): 107-01 \| 研究期程 (迄): 107-12 \| 計畫名稱(英文): Design the active noise cancellation algorithm based on environment-aware-based approach \| 核定編號: VTA107-V1-8-2
轉運蛋白類澱粉沉積症的分子結構與動力學研究(第二年)	計畫類別: 與醫學中心及其他領域學研機構合聘研究計畫 \| 主持人姓名: 余慈顏 \| 中研院計畫編號: AS-VTA-112-13 \| 主持人所屬單位: 原子與分子科學研究所 \| 執行年度: 112 \| 研究期程 (起): 112-01 \| 研究期程 (迄): 112-12 \| 計畫名稱(英文): Structures and molecular dynamics of transthyretin amyloidogenesis (2nd year) \| 核定編號: VTA112-V1-7-3