中研院發表生物資訊演算工具，有效提升基因體研究效率
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標題中研院發表生物資訊演算工具，有效提升基因體研究效率的日期是2004/12/20, 研究團隊是莊樹諄, 內容描述是在全球科學家持續不斷的對基因體做各種假設與求證的研究工作之際，生物資訊學也因應而蓬勃的發展。中央研究院基因體研究中心的生物資訊組研究人員最近於該領域權威的期刊Bioinformatics，發表對於基因預測與多樣切割(Alternative Splicing，簡稱AS)所發明的演算工具。.

日期	2004/12/20
研究團隊	莊樹諄
標題	中研院發表生物資訊演算工具，有效提升基因體研究效率
URL	http://www.genomics.sinica.edu.tw/index.php/tw/news/news-archives/159-2009-09-08-08-39-12
內容描述	在全球科學家持續不斷的對基因體做各種假設與求證的研究工作之際，生物資訊學也因應而蓬勃的發展。中央研究院基因體研究中心的生物資訊組研究人員最近於該領域權威的期刊Bioinformatics，發表對於基因預測與多樣切割(Alternative Splicing，簡稱AS)所發明的演算工具。

日期

2004/12/20

研究團隊

莊樹諄

標題

中研院發表生物資訊演算工具，有效提升基因體研究效率

URL

http://www.genomics.sinica.edu.tw/index.php/tw/news/news-archives/159-2009-09-08-08-39-12

內容描述

在全球科學家持續不斷的對基因體做各種假設與求證的研究工作之際，生物資訊學也因應而蓬勃的發展。中央研究院基因體研究中心的生物資訊組研究人員最近於該領域權威的期刊Bioinformatics，發表對於基因預測與多樣切割(Alternative Splicing，簡稱AS)所發明的演算工具。

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被圈住的心靈Part II:探討基因型、環狀RNA與自閉症間的因果關係網路	日期: 2022/12/30 \| 研究團隊: 莊樹諄 \| 內容描述: 基因體研究中心研究員莊樹諄團隊，在2020年首度建構自閉症腦組織的環狀RNA與基因間調控網路圖譜之後（見中研院研究報導：被圈住的心靈Part I），進一步結合不同型式的體學資料(omics data)... @ 中央研究院基因體研究中心-歷年研究新聞
「被圈住的心靈！」首度建構自閉症腦組織的環狀RNA與基因間調控網路圖譜	日期: 2020/5/13 \| 研究團隊: 莊樹諄 \| 內容描述: 自閉症譜系障礙(autism spectrum disorder，簡稱ASD)是一種腦部發育障礙所導致的複雜疾病，患者往往在社交溝通、互動及表達上有障礙，成因目前仍未有定論，普遍認為與遺傳及基因變異有... @ 中央研究院基因體研究中心-歷年研究新聞
RNA編輯事件:基因突變的神救援還是豬隊友?	日期: 2019/10/24 \| 研究團隊: 莊樹諄 \| 內容描述: 中研院基因體研究中心莊樹諄研究員團隊，運用生物資訊分析，領先全球首次提出，DNA序列突變的危害性，應該結合RNA轉譯資料分析，才能更精確地評估這個突變的危害程度。這個突破性的研究，最近在《基因體研究》... @ 中央研究院基因體研究中心-歷年研究新聞
生物資訊演算法，找出對全能性幹細胞功能性具關鍵力的分子間剪接RNA	日期: 2013/12/3 \| 研究團隊: 莊樹諄 \| 內容描述: 基因體研究中心莊樹諄老師與細胞與個體生物學研究所郭紘志老師，結合生物資訊與幹細胞的研究，成功的開發出一個尋找分子間剪接(Trans-splicing)RNA的流程，將之命名為TSscan。這個流程包括... @ 中央研究院基因體研究中心-歷年研究新聞
莊樹諄	聘書職級: 教授 \| 專兼任: 兼任 \| 單位名稱: 基因體與系統生物學學位學程 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 \| 教師專長: 比較暨演化基因體、生物資訊、基因網路 @ 大學校院教師學術專長彙整表
莊樹諄	聘書職級: 教授 \| 專兼任: 兼任 \| 單位名稱: 生命科學系 \| 學校名稱: 國立臺灣師範大學 \| 教師專長: 基因體註解、演化分析上相關技術的研發 @ 大學校院教師學術專長彙整表
運用跨物種EST序列來尋找新的外顯子以及選擇性剪接事件	作者: 王宥崴 \| 指導教授: 莊樹諄楊致芳 \| 學位類別: 碩士 \| 畢業學年度: 102 \| 論文名稱(外文): A cross-species EST-based pipeline for identification of exons and alternatively spliced variants \| 系所名稱: 資訊工程學系 \| 學校名稱: 國立臺北大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統
全面性分析在自閉症表現量異常的環狀核糖核酸及環狀核糖核酸–微小核糖核酸–信使核糖核酸間相互調控網路	作者: 陳彥如 \| 指導教授: 莊樹諄 \| 學位類別: 博士 \| 畢業學年度: 108 \| 論文名稱(外文): Integrative analysis of circular RNA dysregulation and circular RNA-microRNA-mRNA regulatory axes in... \| 系所名稱: 基因體與系統生物學學位學程 \| 學校名稱: 國立臺灣大學 @ 國家圖書館臺灣博碩士論文知識加值系統

被圈住的心靈Part II:探討基因型、環狀RNA與自閉症間的因果關係網路

日期: 2022/12/30 | 研究團隊: 莊樹諄 | 內容描述: 基因體研究中心研究員莊樹諄團隊，在2020年首度建構自閉症腦組織的環狀RNA與基因間調控網路圖譜之後（見中研院研究報導：被圈住的心靈Part I），進一步結合不同型式的體學資料(omics data)...

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「被圈住的心靈！」首度建構自閉症腦組織的環狀RNA與基因間調控網路圖譜

日期: 2020/5/13 | 研究團隊: 莊樹諄 | 內容描述: 自閉症譜系障礙(autism spectrum disorder，簡稱ASD)是一種腦部發育障礙所導致的複雜疾病，患者往往在社交溝通、互動及表達上有障礙，成因目前仍未有定論，普遍認為與遺傳及基因變異有...

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日期: 2019/10/24 | 研究團隊: 莊樹諄 | 內容描述: 中研院基因體研究中心莊樹諄研究員團隊，運用生物資訊分析，領先全球首次提出，DNA序列突變的危害性，應該結合RNA轉譯資料分析，才能更精確地評估這個突變的危害程度。這個突破性的研究，最近在《基因體研究》...

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生物資訊演算法，找出對全能性幹細胞功能性具關鍵力的分子間剪接RNA

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莊樹諄

聘書職級: 教授 | 專兼任: 兼任 | 單位名稱: 基因體與系統生物學學位學程 | 學校名稱: 國立臺灣大學 | 教師專長: 比較暨演化基因體、生物資訊、基因網路

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聘書職級: 教授 | 專兼任: 兼任 | 單位名稱: 生命科學系 | 學校名稱: 國立臺灣師範大學 | 教師專長: 基因體註解、演化分析上相關技術的研發

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終結新冠疫情新曙光?廣效新冠肺炎RNA疫苗	日期: 2022/2/15 \| 研究團隊: 翁啟惠 \| 馬徹 \| 林國儀 \| 內容描述: 自2019年12月爆發而造成嚴重急性呼吸系統疾病的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2) ，於25個月內傳播全世界且不斷的突變，造成超過4.1億人感染和580萬人死亡。接種疫苗是目前控制新型冠狀病毒傳播...
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轉動魔術方塊的推手Prp28掌控基因剪接準確度	日期: 2021/6/25 \| 研究團隊: 張典顯 \| 內容描述: 生活中，我們或多或少都接觸過魔術方塊。快手甚至可以在十二秒內就把六個面都轉好，熟練精確度讓人瞠目結舌。很少人知道在基因的世界裡，也存在著類似魔術方塊的一部機器－剪接體 (Spliceosome)，它靠...
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迎戰新冠變種病毒單醣化棘突蛋白疫苗提供更有效的保護	日期: 2021/6/3 \| 研究團隊: 馬徹 \| 翁啟惠 \| 內容描述: 新冠肺炎疫情爆發以來，已經造成全球四億四千萬人確診，並有超過六百萬人染疫死亡。時至今日雖已有許多COVID-19疫苗可供使用，但由於SARS-CoV-2病毒變種能力超強，極有可能擺脫當前疫苗誘發的保護...
CLEC18A基因單一胺基酸的變異可倍增抗病毒的免疫力	日期: 2021/4/30 \| 研究團隊: 謝世良 \| 內容描述: CLEC18A是C-型凝集素(C type lectin)的一員，而C-型凝集素一直被認為與生物體內的免疫反應相關。基因體中心特聘研究員謝世良團隊發現，CLEC18A在抗病毒的免疫反應中，擔任監測哨兵...
簡化「新冠病毒」用藥「瑞德西韋」製程，為新型傳染病「立百病毒」的防禦做準備	日期: 2021/4/14 \| 研究團隊: 洪上程 \| 翁啟惠 \| 內容描述: 「新冠肺炎」的疫情在全世界已經延燒多時，隨著新的突變種陸續被發現，完全沒有消停的跡象。美國吉利德科學公司 (Gilead Sciences, Inc.) 研發的抗病毒藥物「瑞德西韋」，相繼獲得美國、日...
橋粒蛋白DSG2是牽動乳癌生成與轉移的要角	日期: 2021/2/4 \| 研究團隊: 黃雯華 \| 內容描述: 由於醫療科技的日新月異，乳癌的平均五年存活率已高達90%，但是，轉移復發仍舊是患者的噩夢，一旦發生轉移，五年存活率從90%陡降到30%。因此，目前乳癌治療的重點，除了針對原發性腫瘤外，更重要的是得想辦...
從現有藥物和保健品找出有效對抗新冠病毒感染的藥方	日期: 2021/1/27 \| 研究團隊: 洪上程 \| 翁啟惠 \| 內容描述: 2020年COVID-19挾著驚人的傳染速度席捲全球，面對這一個不斷改版升級、至今已經有三十萬種突變的對手，各國無不卯足全力應戰。在疾病的預防上，近來多家藥廠的疫苗陸續上市，但是這次面對的是隨著地域隨...
中研院基因體研究中心登峰計畫成果（2006-2020）	日期: 2021/1/14 \| 研究團隊: 基因體研究中心 \| 內容描述: 自2003年SARS疫情爆發後，有鑑於我國尚未建立自己的完整研發能量以因應突發的新興傳染病及其他重大疾病；加上中研院的基礎研究也緩不濟急，尚未銜接轉譯研究，將基礎研究成果加以驗證，並經由技轉，進行產品...
李文華團隊從細胞癌化環節內找出胰臟癌轉移的罩門	日期: 2021/3/4 \| 研究團隊: 李文華 \| 胡春美 \| 內容描述: 療胰臟癌棘手的難題之一，就是確診時通常癌細胞已經轉移了！中研院基因體中心李文華研究團隊持續鑽研，不但確認IL-17RB對於胰臟癌的轉移有至關重要的作用，並循線摸索出更清楚的癌化訊息傳遞機制，他們打造出...
TDP-43是讓阿茲海默症加速惡化的幫手	日期: 2020/11/27 \| 研究團隊: 陳韻如 \| 內容描述: 阿茲海默症是最常見的失智症，失智症並不屬於正常的老化現象，而是一種大腦疾病。其症狀不僅是記憶力減退，還會影響其他認知功能，包括語言、空間感等各方面的退化，嚴重程度足以干擾日常生活。基因體中心副研究員陳...
嵌合並單醣化血凝集素，做出可抗人及禽流感的廣效疫苗	日期: 2020/8/11 \| 研究團隊: 翁啟惠 \| 內容描述: 雖說接種疫苗是預防流感的最好方法，流感疫苗的施打也已經行之多年，但是，流感病毒不斷地突變仍然是科學家的痛。打造廣效流感疫苗，對抗各種異株(cross strains)和不同亞型(cross subty...

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