環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告
- 經濟部產業技術司–可移轉技術資料集 @ 經濟部

技術名稱-中文環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告的執行單位是資策會, 產出年度是104, 產出單位是資策會, 計畫名稱是資策會創新前瞻技術研究計畫, 領域是智慧科技, 技術規格是1. 整合現行基因體學研究之系統性生物路徑分析方法,並評估其應用於環境基因體學之可行性 2. 針對前項分析流程之成果,設計整合性生物路徑分析方法,與分析結果呈現方式, 潛力預估是藉由分析基因體生物路徑分析演算法之特性,鑑別運用巨量資料分析運算技術(e.g. batch computing、real-time computing and graph computing)將遭遇的瓶頸,研發巨量資料版的環境基因體生物路徑分析工具,藉以得知生物的代謝及調控路徑,能夠更清楚得知菌種之....

序號7857
產出年度104
技術名稱-中文環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告
執行單位資策會
產出單位資策會
計畫名稱資策會創新前瞻技術研究計畫
領域智慧科技
已申請專利之國家美國、中國、台灣
已獲得專利之國家
技術現況敘述-中文人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。
技術現況敘述-英文The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.
技術規格1. 整合現行基因體學研究之系統性生物路徑分析方法,並評估其應用於環境基因體學之可行性 2. 針對前項分析流程之成果,設計整合性生物路徑分析方法,與分析結果呈現方式
技術成熟度雛型
可應用範圍基因體分析個人化醫療應用
潛力預估藉由分析基因體生物路徑分析演算法之特性,鑑別運用巨量資料分析運算技術(e.g. batch computing、real-time computing and graph computing)將遭遇的瓶頸,研發巨量資料版的環境基因體生物路徑分析工具,藉以得知生物的代謝及調控路徑,能夠更清楚得知菌種之間的關係。
聯絡人員邱育賢
電話02-66072950
傳真02-66072966
電子信箱amuelchiu@iii.org.tw
參考網址http://無
所須軟硬體設備硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28
需具備之專業人才環境基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、臨床醫師、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員
同步更新日期2023-07-22

序號

7857

產出年度

104

技術名稱-中文

環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告

執行單位

資策會

產出單位

資策會

計畫名稱

資策會創新前瞻技術研究計畫

領域

智慧科技

已申請專利之國家

美國、中國、台灣

已獲得專利之國家

技術現況敘述-中文

人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。

技術現況敘述-英文

The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.

技術規格

1. 整合現行基因體學研究之系統性生物路徑分析方法,並評估其應用於環境基因體學之可行性 2. 針對前項分析流程之成果,設計整合性生物路徑分析方法,與分析結果呈現方式

技術成熟度

雛型

可應用範圍

基因體分析個人化醫療應用

潛力預估

藉由分析基因體生物路徑分析演算法之特性,鑑別運用巨量資料分析運算技術(e.g. batch computing、real-time computing and graph computing)將遭遇的瓶頸,研發巨量資料版的環境基因體生物路徑分析工具,藉以得知生物的代謝及調控路徑,能夠更清楚得知菌種之間的關係。

聯絡人員

邱育賢

電話

02-66072950

傳真

02-66072966

電子信箱

amuelchiu@iii.org.tw

參考網址

http://無

所須軟硬體設備

硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28

需具備之專業人才

環境基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、臨床醫師、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員

同步更新日期

2023-07-22

根據名稱 環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告 找到的相關資料

無其他 環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告 資料。

[ 搜尋所有 環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告 ... ]

根據姓名 資策會 找到的相關資料

(以下顯示 8 筆) (或要:直接搜尋所有 資策會 ...)

【新竹場】人力資源管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-02-11 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-06 16:00:00 | 地區縣市: 新竹市 | 活動地點: 新竹縣新豐鄉新興路1號 | 地點名稱: 明新科技大學

@ 新創圓夢網活動看板

【台中場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-03-18 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-27 16:00:00 | 地區縣市: 臺中市 | 活動地點: 台中市西屯區台灣大道四段1727號 | 地點名稱: 東海大學推廣部

@ 新創圓夢網活動看板

【台中場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-05-06 09:00:00 | 結束時間: 2023-07-08 16:00:00 | 地區縣市: 臺中市 | 活動地點: 台中市西屯區台灣大道四段1727號 | 地點名稱: 東海大學推廣部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-02-12 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-07 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-05-07 09:00:00 | 結束時間: 2023-07-09 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-06-04 09:00:00 | 結束時間: 2023-08-06 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

【台北場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-09-10 09:00:00 | 結束時間: 2023-11-19 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

林文傑

主要專長: 新事業規劃, 品牌行銷策略, 商業模式, 商業合作 | 所在地: 新北市 | 現職: 梅迪奇資產管理股份有限公司/負責人 | 主要經歷: 台灣發行量最大周刊,商業周刊數據商業中心/經理台灣最大計程車隊,台灣大車隊(股)新商模部/資深經理台灣最大汽車芳香劑代工廠,睿澤企業(股)/行銷暨總經理特助台灣3C通路龍頭,燦坤實業(股)/網銷暨行銷...

@ 創業顧問名單

【新竹場】人力資源管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-02-11 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-06 16:00:00 | 地區縣市: 新竹市 | 活動地點: 新竹縣新豐鄉新興路1號 | 地點名稱: 明新科技大學

@ 新創圓夢網活動看板

【台中場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-03-18 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-27 16:00:00 | 地區縣市: 臺中市 | 活動地點: 台中市西屯區台灣大道四段1727號 | 地點名稱: 東海大學推廣部

@ 新創圓夢網活動看板

【台中場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-05-06 09:00:00 | 結束時間: 2023-07-08 16:00:00 | 地區縣市: 臺中市 | 活動地點: 台中市西屯區台灣大道四段1727號 | 地點名稱: 東海大學推廣部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-02-12 09:00:00 | 結束時間: 2023-05-07 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-05-07 09:00:00 | 結束時間: 2023-07-09 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-06-04 09:00:00 | 結束時間: 2023-08-06 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

【台北場】薪資管理師認證班

活動類型: 課程 | 付費方式: 收費 | 開始時間: 2023-09-10 09:00:00 | 結束時間: 2023-11-19 16:00:00 | 地區縣市: 臺北市 | 活動地點: 台北市大安區建國南路二段231號 | 地點名稱: 中國文化大學建國分部

@ 新創圓夢網活動看板

林文傑

主要專長: 新事業規劃, 品牌行銷策略, 商業模式, 商業合作 | 所在地: 新北市 | 現職: 梅迪奇資產管理股份有限公司/負責人 | 主要經歷: 台灣發行量最大周刊,商業周刊數據商業中心/經理台灣最大計程車隊,台灣大車隊(股)新商模部/資深經理台灣最大汽車芳香劑代工廠,睿澤企業(股)/行銷暨總經理特助台灣3C通路龍頭,燦坤實業(股)/網銷暨行銷...

@ 創業顧問名單
[ 搜尋所有 資策會 ... ]

根據電話 02-66072950 找到的相關資料

(以下顯示 2 筆) (或要:直接搜尋所有 02-66072950 ...)

# 02-66072950 於 經濟部產業技術司–可移轉技術資料集 - 1

序號7852
產出年度104
技術名稱-中文腸胃道基因體之特定疾病巨量運算系統雛形
執行單位資策會
產出單位資策會
計畫名稱資策會創新前瞻技術研究計畫
領域智慧科技
已申請專利之國家美國、中國、台灣
已獲得專利之國家
技術現況敘述-中文人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。
技術現況敘述-英文The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.
技術規格1. 環境基因體分析演算法之使用的資料結構特性分析 2. 進行巨量資料分析運算之原始系統效能分析 3. 各式客製化技術設計對應之系統效能分析 4. 環境基因體分析演算法平行化之技術特徵描述 5. 系統雛型架構與流程設計與驗證
技術成熟度雛型
可應用範圍基因體分析個人化醫療應用
潛力預估消化系統微生物組中的微生物,其組成的群落構成了一個巨大而複雜的基因資料庫,在這個資料庫中既包含代表不同微生物身份的系統發育標記基因(如16S rRNA基因),也包含各種具代謝功能的基因,因此需藉助生物資訊及資料探勘的技術清楚解析各微生物群落的關聯,確定微生物群落的組成與功能,進一步研究環境基因體的主要調控途徑,了解人體微生物群落的變化與人類健康的關係。
聯絡人員邱育賢
電話02-66072950
傳真02-66072966
電子信箱amuelchiu@iii.org.tw
參考網址
所須軟硬體設備硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28
需具備之專業人才腸胃道基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、腸胃道科臨床醫師、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員
序號: 7852
產出年度: 104
技術名稱-中文: 腸胃道基因體之特定疾病巨量運算系統雛形
執行單位: 資策會
產出單位: 資策會
計畫名稱: 資策會創新前瞻技術研究計畫
領域: 智慧科技
已申請專利之國家: 美國、中國、台灣
已獲得專利之國家:
技術現況敘述-中文: 人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。
技術現況敘述-英文: The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.
技術規格: 1. 環境基因體分析演算法之使用的資料結構特性分析 2. 進行巨量資料分析運算之原始系統效能分析 3. 各式客製化技術設計對應之系統效能分析 4. 環境基因體分析演算法平行化之技術特徵描述 5. 系統雛型架構與流程設計與驗證
技術成熟度: 雛型
可應用範圍: 基因體分析個人化醫療應用
潛力預估: 消化系統微生物組中的微生物,其組成的群落構成了一個巨大而複雜的基因資料庫,在這個資料庫中既包含代表不同微生物身份的系統發育標記基因(如16S rRNA基因),也包含各種具代謝功能的基因,因此需藉助生物資訊及資料探勘的技術清楚解析各微生物群落的關聯,確定微生物群落的組成與功能,進一步研究環境基因體的主要調控途徑,了解人體微生物群落的變化與人類健康的關係。
聯絡人員: 邱育賢
電話: 02-66072950
傳真: 02-66072966
電子信箱: amuelchiu@iii.org.tw
參考網址:
所須軟硬體設備: 硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28
需具備之專業人才: 腸胃道基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、腸胃道科臨床醫師、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員

# 02-66072950 於 經濟部產業技術司–可移轉技術資料集 - 2

序號7858
產出年度104
技術名稱-中文環境基因體分析演算法之技術分析與設計報告
執行單位資策會
產出單位資策會
計畫名稱資策會創新前瞻技術研究計畫
領域智慧科技
已申請專利之國家美國、中國、台灣
已獲得專利之國家
技術現況敘述-中文人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。
技術現況敘述-英文The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.
技術規格1. 整合現行標準NGS與環境基因體學分析流程 2. 建立評價各分析流程之衡量標準 3. 規畫本計畫之分析流程架構
技術成熟度雛型
可應用範圍基因體分析個人化醫療應用
潛力預估藉由分析環境基因體分析演算法之特性,研發巨量資料版的基因體演算法分析工具,滿足大量環境基因體分析之所需,利用加速過的工具進行大規模搜尋,協助臺灣進入創新及高附加價值的個人化醫療產業。
聯絡人員邱育賢
電話02-66072950
傳真02-66072966
電子信箱amuelchiu@iii.org.tw
參考網址
所須軟硬體設備硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28
需具備之專業人才環境基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員
序號: 7858
產出年度: 104
技術名稱-中文: 環境基因體分析演算法之技術分析與設計報告
執行單位: 資策會
產出單位: 資策會
計畫名稱: 資策會創新前瞻技術研究計畫
領域: 智慧科技
已申請專利之國家: 美國、中國、台灣
已獲得專利之國家:
技術現況敘述-中文: 人體內細菌族群與人體健康的關聯性為新興熱門之研究,國際知名期刊Nature與Science曾於2013年發表兩篇相關研究,分別指出腸胃道菌群的改變與代謝疾病之關聯及癌症患者化療效果與腸胃道菌群多樣性有關。但傳統細菌分析方式無法一次涵蓋所有環境中微生物組成,而次世代定序技術能一次涵蓋所有菌群鑑別與定量檢測,故已成為細菌分析之新技術趨勢。 然而次世代定序技術解決一次涵蓋所有菌群的問題,但其產生的巨量細菌基因資料也衍生了新的挑戰,包含分析結果解讀往往缺乏系統性,難以實際應用於臨床應用與個人化醫療發展,以及環境中細菌群落之基因體分析急需解決運算資源需求和GB數量級的存取問題。本計畫研發目的在於研究環境基因體領域專業的分析流程和架構,並研發更精進的運算技術輔助,以加速我國環境基因體的研究發展,加速找出關鍵致病原因,進而應用於環境基因體相關疾病的治療與發展個人化醫療技術。
技術現況敘述-英文: The relevance between bacterial populations and human body health is an emerging & popular research. The internationally renowned periodical "Nature & Science" published 2 related researches in 2013 respectively indicating the change of bacterial populations in intestines & stomach, relevance of metabolic diseases, the chemotherapy effects of cancer patients are all associated with the diversification of bacterial populations in intestines & stomach. But conventional bacterial analytic methods can't cover the composition of microorganisms in all environments at once. While the next generation sequencing technology can cover the identification and quantitative determination of all bacterial populations at once thus it has become the new technical trend of bacterial analysis. While when the next generation sequencing technology covers the problems of all bacterial populations at once, new challenges of generated massive bacterial genetic data are derived including the constantly insufficient systematicness of interpretation of analytic results to be difficult in physically applied in clinical applications and individualized medical development. And the genosome analysis of bacterial populations in environment is desperately in need of solutions to computing resource requirements and access problems of GB magnitude. The R&D purpose of this project lies in studies of the professional analytic process and framework of environmental genosome domain as well as the development of more advanced & supplementary computing technologies so as to accelerate domestic R&D of environmental genosome in order to quickly find out the root causes of diseases, and furtherly apply the technology to the treatments of environmental genosome related diseases and develop individualized medical technologies.
技術規格: 1. 整合現行標準NGS與環境基因體學分析流程 2. 建立評價各分析流程之衡量標準 3. 規畫本計畫之分析流程架構
技術成熟度: 雛型
可應用範圍: 基因體分析個人化醫療應用
潛力預估: 藉由分析環境基因體分析演算法之特性,研發巨量資料版的基因體演算法分析工具,滿足大量環境基因體分析之所需,利用加速過的工具進行大規模搜尋,協助臺灣進入創新及高附加價值的個人化醫療產業。
聯絡人員: 邱育賢
電話: 02-66072950
傳真: 02-66072966
電子信箱: amuelchiu@iii.org.tw
參考網址:
所須軟硬體設備: 硬體環境 建議配置四台機器,每台硬體資訊如下: 中央處理器:(Intel Pentinum 4、2.40GHz)*2 記憶體:32GB 硬碟:2TB *軟體環境 作業系統:Ubuntu 14 (1) JAVA版本 : java sdk 7 (2) Cloudera相關套件版本如下: CDH-4.7.1 hadoop hadoop-2.0.0+1612 hcatalog hcatalog-0.5.0+16 hive hive-0.10.0+263 oozie oozie-3.3.2+108 pig pig-0.11.0+46 sqoop sqoop2-1.99.2+102 zookeeper zookeeper-3.4.5+28
需具備之專業人才: 環境基因體生物背景、生物工程背景、分子生物學背景、巨量資料平台架構人員及巨量資料分析人員
[ 搜尋所有 02-66072950 ... ]

與環境基因體之生物路徑分析技術分析與設計報告同分類的經濟部產業技術司–可移轉技術資料集

Home Portal Server

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 智慧型資訊系統技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: AES、DES、WPA | 潛力預估: 家庭網路安全隨著數位家庭網路服務的興起而倍受重視,國內尚無相關應用產品,仍待推廣落實。

數位學習內容版權發行交易技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: 支援SCORM 1.2 | 潛力預估: 目前已有廠商開始導入,預期未來需求會不斷增加

空間互動數位學習內容處理技術?

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: | 潛力預估: 可應用在數位內容市場

基於辨音成分之語音發音評量技術?

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: · 適用於任何語言(Language Independent) · 不需要預先錄製比對範音、可練習任意口說內容(Text Independent) · 可依據學習目標調整評量機制 · 動態語音文字同... | 潛力預估: 除了提供學習者發音的評量分數外,基於辨音成分的特性將可作為發音問題診斷及矯正的基礎,未來更可以導入音韻法則處理連音及省音效應,引導學習者如Native speaker般發音

英文自動模擬測驗出題技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: · 可選定出題來源文章 · 可設定要測試的生字、片語及文法概念 · 可設定題目類型(克漏字填充題、克漏字選擇題、挑錯選擇題、改錯選擇題)及題型分布 | 潛力預估: 除了提供學習者發音的評量分數外,基於辨音成分的特性將可作為發音問題診斷及矯正的基礎,未來更可以導入音韻法則處理連音及省音效應,引導學習者如Native speaker般發音

WCDMA Base-band Common IP

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 符合3GPP R4規格之硬體演算法設計技術、完成符合3GPP R4規格之測試驗證平台技術、進行符合3GPP R5規格之硬體演算法先期研究 | 潛力預估: 掌握自有IP, 引導國內公司投入WCDMA行動絡終端晶片設計研發, 促進國內3G晶片設計廠商投資。

WCDMA RF Transceiver IC

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. Current consumption of 27.5mA, 45mA-89mA and 30mA in Rx, Tx and Sx chip. 2. A max. gain of 94.5dB... | 潛力預估: 增進對第三代WCDMA手機系統關鍵零件的掌握,促進國內3G晶片設計廠投資。

WCDMA IP Verification Platform

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: Porting資策會開發之WCDMA R4 L2/L3 Protocol於CCL ARM target board、整合WCDMA R4 L2/L3 Protocol+L1 Software+第一版符... | 潛力預估: 建立Layer 1 軟體與上層protocol軟體整合驗證之技術、建立TTCN Test Cases 開發之技術

Miniaturized RF Module

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 使用16層LTCC為基板,尺寸為25x25mm2 2. 符合IEEE 802.11a RF電路規格 3. 符合 GPRS電路規格 4.模組內埋帶通濾波器,非平衡至平衡轉換器,電感,電容以及傳輸線... | 潛力預估: 1. 縮小 RF模組尺寸,提升電路的電氣特性,增加系統設計自由度並提高產品競爭力。2. 提昇關鍵零組鍵國內廠商自製率。3. 提供製程廠商內埋元件技術,提升競爭力。

Dual-mode Four-Band PA Module

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 包含GPRS與WLAN系統之單一功率放大器模組 2.自行新開發之2.4GHz GaAs HBT PA MMIC 3.利用LTCC內埋元件技術縮小功率放大器模組的尺寸 4.完成之模組整體體積為14... | 潛力預估: WLAN及雙模終端應用及市場快速成長,亦相當適合我國產業切入,本技術將加強無線終端設備的小型化產品競爭力,大幅提高市場接受度。

高速移動寬頻通訊技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 支援 120 km/hr移動速度之基頻電路(PHY)收發器模擬與演算法設計平台。2. 適用於30~60km/hr高速移動速度之基頻電路(PHY)之演算法設計。3. 適用於30~60km/hr高... | 潛力預估: 強化國內汽車零組件業者研發能量,搶搭逐年倍增車輛電子產業市場。本計畫之執行

Cellular/WLAN AAA Technology

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 完成3GPP AAA Server與AAA Proxy開發 | 潛力預估: 協助行動電話業者建置EAP-SIM整合認證系統, 使WLAN上網具有商業模式,可加速雙網手機與內容產業的發展

Telecom Enabled Platform Technology

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 研發OSA Gateway Phase 4.0,功能滿足以下規格:Multiparty Call Control SCF(TS29.198-04-3 v5.2.0)、Mobility SCF(TS29... | 潛力預估: 提供國內content/service provider更便利的介面來開發電信相關的多媒體服務,希望豐富data service的種類以帶動mobile internet產業 ; 亦可提供全國各大專...

IP多媒體通訊應用技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 提供IETF SIP Extension協定技術。2. 提供IETF SIMPLE協定技術。3. 提供IETF SIMPLE / XCAP協定技術。4. 提供IETF SIP draft – E... | 潛力預估: 本技術為自行開發之成果,可技轉國內應用服務開發商,並應用於Cellular/WLAN雙網手機之服務開發。

EPON Access Gateway

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 寬頻有線通訊系統技術發展四年計畫 | 領域: | 技術規格: 符合IEEE 802.3ah的EPON系統 | 潛力預估: 非常有潛力

Home Portal Server

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 智慧型資訊系統技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: AES、DES、WPA | 潛力預估: 家庭網路安全隨著數位家庭網路服務的興起而倍受重視,國內尚無相關應用產品,仍待推廣落實。

數位學習內容版權發行交易技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: 支援SCORM 1.2 | 潛力預估: 目前已有廠商開始導入,預期未來需求會不斷增加

空間互動數位學習內容處理技術?

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: | 潛力預估: 可應用在數位內容市場

基於辨音成分之語音發音評量技術?

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: · 適用於任何語言(Language Independent) · 不需要預先錄製比對範音、可練習任意口說內容(Text Independent) · 可依據學習目標調整評量機制 · 動態語音文字同... | 潛力預估: 除了提供學習者發音的評量分數外,基於辨音成分的特性將可作為發音問題診斷及矯正的基礎,未來更可以導入音韻法則處理連音及省音效應,引導學習者如Native speaker般發音

英文自動模擬測驗出題技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 數位學習技術研發五年計畫 | 領域: | 技術規格: · 可選定出題來源文章 · 可設定要測試的生字、片語及文法概念 · 可設定題目類型(克漏字填充題、克漏字選擇題、挑錯選擇題、改錯選擇題)及題型分布 | 潛力預估: 除了提供學習者發音的評量分數外,基於辨音成分的特性將可作為發音問題診斷及矯正的基礎,未來更可以導入音韻法則處理連音及省音效應,引導學習者如Native speaker般發音

WCDMA Base-band Common IP

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 符合3GPP R4規格之硬體演算法設計技術、完成符合3GPP R4規格之測試驗證平台技術、進行符合3GPP R5規格之硬體演算法先期研究 | 潛力預估: 掌握自有IP, 引導國內公司投入WCDMA行動絡終端晶片設計研發, 促進國內3G晶片設計廠商投資。

WCDMA RF Transceiver IC

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. Current consumption of 27.5mA, 45mA-89mA and 30mA in Rx, Tx and Sx chip. 2. A max. gain of 94.5dB... | 潛力預估: 增進對第三代WCDMA手機系統關鍵零件的掌握,促進國內3G晶片設計廠投資。

WCDMA IP Verification Platform

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: Porting資策會開發之WCDMA R4 L2/L3 Protocol於CCL ARM target board、整合WCDMA R4 L2/L3 Protocol+L1 Software+第一版符... | 潛力預估: 建立Layer 1 軟體與上層protocol軟體整合驗證之技術、建立TTCN Test Cases 開發之技術

Miniaturized RF Module

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 使用16層LTCC為基板,尺寸為25x25mm2 2. 符合IEEE 802.11a RF電路規格 3. 符合 GPRS電路規格 4.模組內埋帶通濾波器,非平衡至平衡轉換器,電感,電容以及傳輸線... | 潛力預估: 1. 縮小 RF模組尺寸,提升電路的電氣特性,增加系統設計自由度並提高產品競爭力。2. 提昇關鍵零組鍵國內廠商自製率。3. 提供製程廠商內埋元件技術,提升競爭力。

Dual-mode Four-Band PA Module

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 包含GPRS與WLAN系統之單一功率放大器模組 2.自行新開發之2.4GHz GaAs HBT PA MMIC 3.利用LTCC內埋元件技術縮小功率放大器模組的尺寸 4.完成之模組整體體積為14... | 潛力預估: WLAN及雙模終端應用及市場快速成長,亦相當適合我國產業切入,本技術將加強無線終端設備的小型化產品競爭力,大幅提高市場接受度。

高速移動寬頻通訊技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 支援 120 km/hr移動速度之基頻電路(PHY)收發器模擬與演算法設計平台。2. 適用於30~60km/hr高速移動速度之基頻電路(PHY)之演算法設計。3. 適用於30~60km/hr高... | 潛力預估: 強化國內汽車零組件業者研發能量,搶搭逐年倍增車輛電子產業市場。本計畫之執行

Cellular/WLAN AAA Technology

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 完成3GPP AAA Server與AAA Proxy開發 | 潛力預估: 協助行動電話業者建置EAP-SIM整合認證系統, 使WLAN上網具有商業模式,可加速雙網手機與內容產業的發展

Telecom Enabled Platform Technology

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 研發OSA Gateway Phase 4.0,功能滿足以下規格:Multiparty Call Control SCF(TS29.198-04-3 v5.2.0)、Mobility SCF(TS29... | 潛力預估: 提供國內content/service provider更便利的介面來開發電信相關的多媒體服務,希望豐富data service的種類以帶動mobile internet產業 ; 亦可提供全國各大專...

IP多媒體通訊應用技術

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 無線通訊技術發展五年計畫 | 領域: | 技術規格: 1. 提供IETF SIP Extension協定技術。2. 提供IETF SIMPLE協定技術。3. 提供IETF SIMPLE / XCAP協定技術。4. 提供IETF SIP draft – E... | 潛力預估: 本技術為自行開發之成果,可技轉國內應用服務開發商,並應用於Cellular/WLAN雙網手機之服務開發。

EPON Access Gateway

執行單位: 工研院電通所 | 產出年度: 93 | 產出單位: | 計畫名稱: 寬頻有線通訊系統技術發展四年計畫 | 領域: | 技術規格: 符合IEEE 802.3ah的EPON系統 | 潛力預估: 非常有潛力

 |